ATCC菌種鑒定常采用以下分離方法：
ATCC子實(shí)體分離：種菇要選朵大蓋厚，柄短，八九分成熟的優(yōu)良品種。如香菇、平菇等。切去菇兩基部，在無菌箱內(nèi)以0.1％的水浸幾分鐘，再用無菌水沖洗并揩干或用75％酒精棉球擦拭菌蓋與菌柄2次，進(jìn)行表面消毒。接種時(shí)，只要將種菇撕開，在萌蓋和菌柄交界處或菌褶處，挑取一小塊組織；移接 到PDA培養(yǎng)基上。置25℃左右溫度下培養(yǎng)3-5天，就可以看到組織上產(chǎn)生白色絨毛狀菌絲，轉(zhuǎn)管擴(kuò)大即得到菌種。
食用菌生產(chǎn)所用的菌種，是提供繁殖而分級(jí)制作的菌絲體培養(yǎng)物，相當(dāng)于高等植物的種子。在自然界中，食用菌繁衍后代依靠孢子，孢子在適宜的環(huán)境下，萌發(fā)成菌絲體。菌絲體生長繁衍達(dá)到生理成熟后，在適宜的環(huán)境下，就可形成子實(shí)體。在人工栽培食用菌時(shí)，孢子雖然是它的種子，但人們至今都不用孢子直接播種，而是用孢子或子實(shí)體組織萌發(fā)而成的純菌絲體作為播種材料。因此，通常所指的菌種，實(shí)際上是經(jīng)過人工培養(yǎng)并進(jìn)一步繁殖的食用菌的純菌絲體。
ATCC菌種分離：茯苓、豬苓、雷丸等菌的子實(shí)體不易采集。而常見的是它貯藏營養(yǎng)的菌核。用菌核分離，同樣可以獲得菌種。方法是將菌核表面洗凈，用酒精或消毒后，切開菌核，取中間組織一小塊，約黃豆大小，接種在PDA 培養(yǎng)基斜面上，保溫培養(yǎng)。
bio-091196 ATCC 700409 Desulfospira joergensenii
bio-091195 ATCC 49244 Mannheimia granulomatis
bio-091194 ATCC 6847 Nocardia carnea
bio-091193 ATCC 27956 Streptococcus agalactiae
bio-091192 ATCC 12403 Streptococcus agalactiae
bio-091191 ATCC 33398 Streptococcus equi subsp.
bio-091189 ATCC 33186 Enterococcus faecalis
bio-091185 ATCC 8104 Arcanobacterium pyogenes
bio-091184 ATCC 9342 Streptococcus sp.
bio-091183 ATCC 15185 Streptococcus sp.
bio-091182 ATCC 11631 Staphylococcus simulans
bio-091181 ATCC 12715 Staphylococcus warneri
bio-091180 ATCC 4012 Staphylococcus aur